Ventilatsioonisüsteem on varjendi elutähtis osa. S1-klassi varjendi peab varustama spetsiaalse ventilatsiooniseadmega. 

Suurema ehk S2-klassi varjendi või kaljuvarjendi jaoks on vaja tõhusamat ventilatsioonisüsteemi kui S1-klassi varjendi puhul.

ESL-CO2 on täisautomaatne regenereeriv süsihappegaasi eemaldamissüsteem, mis võimaldab pikendada isolatsioonis viibimise aega.